Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 RPL12P34-201ENST00000424532 479 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AL136231.1-201ENST00000429407 730 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AL353597.2-202ENST00000434901 373 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
FXNQ16595 LINC00328-2P-201ENST00000436585 219 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
FXNQ16595 PIK3IP1-AS1-201ENST00000440456 554 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AC097359.1-201ENST00000447946 463 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AL157371.1-201ENST00000451910 394 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FXNQ16595 FASTKD1-204ENST00000453153 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
FXNQ16595 YRDCP3-201ENST00000456507 480 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
FXNQ16595 ATP5J-207ENST00000457143 589 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FXNQ16595 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
FXNQ16595 ATP5LP5-201ENST00000483050 299 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
FXNQ16595 RNF138P1-201ENST00000502765 546 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AC009623.1-201ENST00000517964 1131 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FXNQ16595 NAV2-IT1-201ENST00000528204 506 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AP002765.2-201ENST00000532961 666 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AP002989.1-201ENST00000533459 562 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AL671883.2-201ENST00000539514 536 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AC090023.2-201ENST00000540875 545 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FXNQ16595 BICD1-206ENST00000551086 423 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AC244502.3-201ENST00000555460 457 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AC013652.2-202ENST00000558948 910 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AC009117.3-202ENST00000563825 557 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FXNQ16595 MT1CP-201ENST00000567054 174 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AC211486.2-201ENST00000576046 280 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AC053481.3-201ENST00000577881 843 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
FXNQ16595 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AL132655.1-201ENST00000601795 1153 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AC067959.1-201ENST00000604334 379 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
FXNQ16595 uc_338.26-201ENST00000612659 160 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
FXNQ16595 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FXNQ16595 ZNF195-201ENST00000005082 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
FXNQ16595 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
FXNQ16595 RANBP3L-201ENST00000296604 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
FXNQ16595 HELLS-205ENST00000394036 3131 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
FXNQ16595 DNAH3-201ENST00000261383 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
FXNQ16595 BNIP2-202ENST00000415213 1509 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FXNQ16595 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
FXNQ16595 LINC02010-202ENST00000471638 1829 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
FXNQ16595 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
FXNQ16595 DTNA-229ENST00000598142 2509 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
FXNQ16595 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
FXNQ16595 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FXNQ16595 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
FXNQ16595 LINC01613-201ENST00000561476 2780 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FXNQ16595 ADGRF1-203ENST00000371253 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
FXNQ16595 CPB2-202ENST00000439329 1655 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FXNQ16595 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FXNQ16595 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FXNQ16595 OR4N2-201ENST00000315947 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FXNQ16595 OR10R3P-201ENST00000361688 942 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FXNQ16595 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FXNQ16595 RNA5SP485-201ENST00000365053 119 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FXNQ16595 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FXNQ16595 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FXNQ16595 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FXNQ16595 SULT1C2-204ENST00000409880 1206 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AC245052.5-201ENST00000416320 649 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FXNQ16595 LINC00352-201ENST00000425800 552 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AC244453.3-201ENST00000426275 459 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AC093151.2-201ENST00000429109 394 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FXNQ16595 RPS12P17-201ENST00000438591 377 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AL590004.3-202ENST00000445883 451 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FXNQ16595 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FXNQ16595 COX4I1P2-201ENST00000447446 547 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FXNQ16595 LINC01729-201ENST00000450640 358 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AC016027.4-201ENST00000450866 277 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FXNQ16595 IMMP2L-205ENST00000450877 761 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AL365318.1-201ENST00000453128 705 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FXNQ16595 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FXNQ16595 RPS20P32-201ENST00000456044 356 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AC104164.1-201ENST00000460282 590 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FXNQ16595 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FXNQ16595 PFN1P6-201ENST00000476786 399 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AC093267.1-201ENST00000489176 961 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FXNQ16595 RN7SL568P-201ENST00000493069 298 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FXNQ16595 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FXNQ16595 PTGES3P3-201ENST00000511479 482 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FXNQ16595 ARL2BPP6-201ENST00000512757 439 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FXNQ16595 SNORA74.1-201ENST00000516320 180 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FXNQ16595 CYCSP25-201ENST00000525280 316 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AC009652.2-201ENST00000527978 516 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AC002056.2-201ENST00000532913 284 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FXNQ16595 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AC023905.1-201ENST00000559799 1178 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AC092078.2-201ENST00000560900 581 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AC068112.1-201ENST00000580057 346 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 162.7 ms