Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 RPS26P40-201ENST00000435209 294 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 RPS27AP15-201ENST00000447672 466 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 AC115989.1-202ENST00000452153 1150 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 MRPL42P4-201ENST00000453267 443 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 CCDC75P1-201ENST00000469247 791 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 RN7SL41P-201ENST00000476144 297 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 AC083982.1-201ENST00000485679 344 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 AC008728.1-201ENST00000512730 691 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 LY96-202ENST00000518893 430 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 AL035078.3-201ENST00000525382 241 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 CD44-AS1-201ENST00000528869 587 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 AC025035.1-201ENST00000551571 894 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 AL356804.1-201ENST00000553791 448 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 AC026992.1-202ENST00000558454 421 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 AC007448.2-201ENST00000583452 380 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 AL121989.1-201ENST00000585888 746 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 CCDC58P3-201ENST00000590792 430 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 IGKV1OR2-9-201ENST00000603957 287 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 IGKV1OR2-11-201ENST00000604120 287 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 AL133338.2-201ENST00000604292 736 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 MFSD8-245ENST00000641743 948 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 A2MP1-204ENST00000566278 4130 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 AC139713.2-215ENST00000641428 5037 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 MFSD4BP1-201ENST00000513330 1552 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 LINC00622-201ENST00000562811 1570 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 AC005261.4-201ENST00000600047 1385 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 SLC17A1-204ENST00000476801 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 LINC01361-202ENST00000452834 1526 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 SLC10A2-201ENST00000245312 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 LINC02432-202ENST00000509161 2839 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 EMB-205ENST00000514111 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 PMCHL2-201ENST00000415808 1841 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 OR10J6P-201ENST00000289731 930 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 MT-CO3-201ENST00000362079 784 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 SNORA58B-201ENST00000364259 136 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 AL121834.1-202ENST00000404494 277 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 HIGD1AP12-201ENST00000427832 281 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 AC084290.1-201ENST00000434995 374 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 AC076966.1-201ENST00000435560 351 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 GPC6-AS1-201ENST00000436329 698 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 EEF1A1P39-201ENST00000440791 250 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 AC073648.4-201ENST00000442655 781 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 AL160271.1-201ENST00000444708 829 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 AC012355.1-201ENST00000450290 769 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 AC239809.1-201ENST00000450470 217 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 AL391704.1-202ENST00000453889 874 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 AL356289.2-201ENST00000455238 292 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 LINC02049-201ENST00000490647 747 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 AC010273.1-201ENST00000504129 946 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 AC113347.3-201ENST00000509113 148 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 IGLV3-26-201ENST00000520756 302 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 AC117834.1-202ENST00000521203 561 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 AC023442.2-201ENST00000526455 270 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 PTH-202ENST00000529816 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 AL359232.1-201ENST00000556361 442 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 AL133368.2-201ENST00000556978 386 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 AC009101.2-201ENST00000564293 456 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 AC018554.1-201ENST00000565506 800 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 AC110743.1-201ENST00000584870 478 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 DAB1-AS1-208ENST00000586465 748 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 AC068790.7-201ENST00000602347 528 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 BPIFA4P-203ENST00000603168 689 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 MIR7154-201ENST00000620673 73 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 AC244196.2-201ENST00000621184 411 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 LGALS13-204ENST00000621475 494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 AC074099.1-201ENST00000634100 679 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 ZNF663P-202ENST00000641770 1131 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 LINC02211-204ENST00000642024 1070 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 TAS2R20-201ENST00000538986 1381 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CUL4BQ13620 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 PATJ-202ENST00000316485 3657 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 LINC02070-201ENST00000460586 1321 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 STON1-GTF2A1L-203ENST00000402114 3790 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 RASGRP1-209ENST00000559830 1910 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 RIMS1-204ENST00000401910 3542 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 Y_RNA.472-201ENST00000384322 102 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 TANK-203ENST00000402568 878 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 PDSS1P1-201ENST00000422953 1114 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
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