Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 SLC2A3P1-201ENST00000519666 1451 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 VIP-201ENST00000367243 1581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 AL158163.1-201ENST00000603915 1649 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 AL512646.1-201ENST00000269395 1077 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 FAM3C2-201ENST00000312214 681 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 SLAMF6-201ENST00000368055 730 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 PGBD4P8-201ENST00000412993 562 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 AC004022.2-201ENST00000413824 193 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 AC006007.1-201ENST00000422084 672 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 LINC02476-202ENST00000431071 559 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 RPL37P1-201ENST00000432310 284 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 AC105402.2-201ENST00000438503 358 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 PHBP16-201ENST00000446318 950 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 AL929288.2-201ENST00000446368 407 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 RPS6P2-201ENST00000454208 705 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 BTBD11-206ENST00000494235 811 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 RNA5SP49-201ENST00000516450 115 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 RNA5SP519-201ENST00000516480 119 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 AC091564.3-201ENST00000527398 429 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 SNHG1-208ENST00000538266 347 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 PDCD5P1-201ENST00000543528 309 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 AC084398.2-201ENST00000551918 564 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 AC099518.4-204ENST00000567047 380 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 AC010735.1-201ENST00000567305 1026 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 CCDC178-208ENST00000579916 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 BNIP3P31-201ENST00000604515 566 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 AL392112.1-201ENST00000605115 829 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 AC005156.1-201ENST00000613371 573 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 AL035461.2-201ENST00000619201 524 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 GPR34-203ENST00000620846 1282 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 PDCD6IPP1-202ENST00000622242 1064 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 AKAP4-201ENST00000358526 2881 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 CD200R1-204ENST00000471858 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 STK31-205ENST00000433467 3085 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 CNTRL-201ENST00000238341 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 WDR72-204ENST00000559418 3602 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 AC099792.1-203ENST00000634701 2183 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 KYNU-201ENST00000264170 15316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 OR4F6-201ENST00000328882 1238 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 XAGE1A-202ENST00000375600 474 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 XAGE1B-202ENST00000375613 474 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 OTUD6B-202ENST00000404789 1089 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 AL024507.1-201ENST00000412741 274 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 PRELID3BP11-201ENST00000414230 479 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 UBE2V1P9-201ENST00000414760 368 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 LINC01709-201ENST00000415532 634 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 LINC01745-201ENST00000430921 372 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 RPL21P110-201ENST00000433345 446 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 AC005002.1-201ENST00000447458 540 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 OR51B8P-201ENST00000449892 769 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 RPL7P31-201ENST00000450192 724 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 TPTE2P6-203ENST00000450973 649 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 Z95152.1-201ENST00000453556 656 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 AC109458.1-201ENST00000508858 316 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 AC133634.1-201ENST00000517695 566 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 AC025437.2-201ENST00000518103 548 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 AC107373.1-201ENST00000522570 603 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 AP003733.3-201ENST00000524942 788 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 LONRF1-203ENST00000525024 841 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 AP003102.1-201ENST00000525638 661 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 AC124293.1-201ENST00000530034 493 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 OR5AN2P-201ENST00000534535 896 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 AC128707.1-201ENST00000552230 494 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
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CUL4AQ13619 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 AP005433.1-201ENST00000582939 620 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 AC015911.9-201ENST00000591634 185 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 AL161896.1-201ENST00000597248 508 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
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CUL4AQ13619 AC114878.2-201ENST00000604863 1251 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 AC090948.1-201ENST00000607464 549 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 AL121873.1-201ENST00000616013 524 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 LINC00706-201ENST00000628989 699 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 AL590396.4-201ENST00000636779 956 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 AC008703.1-201ENST00000637629 1174 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 AC006927.2-201ENST00000639256 389 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 BAALC-AS1-201ENST00000499522 1353 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 LINC02120-201ENST00000505518 2008 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 BCLAF1-214ENST00000531224 7263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 CNTN5-212ENST00000619298 5734 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 LINC00560-201ENST00000564593 1599 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 CDH8-205ENST00000577730 8009 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 RBBP6-203ENST00000381039 3384 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 FDCSP-201ENST00000317987 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CUL4AQ13619 AC234772.1-201ENST00000377927 937 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
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