Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
SP140Q13342 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SP140Q13342 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
SP140Q13342 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
SP140Q13342 LINC00919-201ENST00000561513 1658 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SP140Q13342 MGAT4A-203ENST00000409391 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SP140Q13342 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SP140Q13342 CR383658.2-201ENST00000547576 1525 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SP140Q13342 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SP140Q13342 AC092747.4-201ENST00000620519 1861 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SP140Q13342 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SP140Q13342 ESD-201ENST00000378697 1079 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SP140Q13342 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SP140Q13342 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SP140Q13342 TANK-206ENST00000406287 875 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SP140Q13342 AC092675.1-201ENST00000409490 561 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SP140Q13342 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SP140Q13342 EBLN1-201ENST00000422359 1208 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SP140Q13342 LINC01740-201ENST00000423842 332 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SP140Q13342 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SP140Q13342 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SP140Q13342 CASP12-204ENST00000433738 709 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SP140Q13342 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SP140Q13342 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SP140Q13342 AC018731.1-201ENST00000447078 576 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SP140Q13342 AC005008.2-202ENST00000447776 439 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SP140Q13342 AC010884.1-201ENST00000456519 642 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SP140Q13342 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SP140Q13342 RN7SL174P-201ENST00000475578 289 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SP140Q13342 AC016746.1-201ENST00000489557 831 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SP140Q13342 CEP170-216ENST00000490813 1070 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SP140Q13342 AC079380.1-201ENST00000507844 619 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SP140Q13342 RNU6-941P-201ENST00000516346 108 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SP140Q13342 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SP140Q13342 MSC-AS1-205ENST00000519068 569 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SP140Q13342 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SP140Q13342 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SP140Q13342 RNASE9-206ENST00000554964 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SP140Q13342 PSMB7P1-201ENST00000556349 514 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SP140Q13342 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SP140Q13342 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SP140Q13342 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SP140Q13342 AC115085.1-201ENST00000588924 229 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SP140Q13342 AC011445.2-201ENST00000599274 173 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SP140Q13342 DARS-AS1-220ENST00000607985 660 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SP140Q13342 AL354760.1-201ENST00000608357 643 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SP140Q13342 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SP140Q13342 AC243756.2-201ENST00000618406 463 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SP140Q13342 AC009704.2-201ENST00000618739 483 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SP140Q13342 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SP140Q13342 AL049767.1-202ENST00000637826 242 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SP140Q13342 ASNSP1-201ENST00000518311 1939 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SP140Q13342 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SP140Q13342 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SP140Q13342 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SP140Q13342 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SP140Q13342 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SP140Q13342 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SP140Q13342 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SP140Q13342 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SP140Q13342 AC096656.1-201ENST00000623826 1364 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
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SP140Q13342 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SP140Q13342 RBBP6-203ENST00000381039 3384 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SP140Q13342 LINC01109-201ENST00000603837 3081 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SP140Q13342 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
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SP140Q13342 ARL4A-204ENST00000396664 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
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SP140Q13342 AC092647.1-201ENST00000420654 287 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
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SP140Q13342 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SP140Q13342 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SP140Q13342 AL139230.1-201ENST00000440094 425 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SP140Q13342 RAB11AP1-201ENST00000442978 646 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SP140Q13342 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SP140Q13342 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SP140Q13342 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SP140Q13342 AC108463.1-201ENST00000450258 347 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SP140Q13342 BX842559.2-201ENST00000451418 605 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SP140Q13342 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SP140Q13342 AC084117.1-201ENST00000496975 270 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SP140Q13342 ZBTB20-AS3-201ENST00000498630 464 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SP140Q13342 AC093722.1-201ENST00000504882 489 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SP140Q13342 NREP-AS1-202ENST00000507222 610 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SP140Q13342 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SP140Q13342 AC109464.3-201ENST00000509456 204 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SP140Q13342 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SP140Q13342 RNA5SP373-201ENST00000517271 95 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SP140Q13342 AC016074.1-201ENST00000518339 636 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
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