Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 AC091588.1-201ENST00000578504 359 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 MIR4330-201ENST00000579077 105 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 RN7SL176P-201ENST00000580352 264 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 RN7SL356P-201ENST00000582228 248 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 VN1R87P-201ENST00000596706 487 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 AC000068.2-201ENST00000608816 460 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 AC126915.2-201ENST00000610957 190 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 FAM197Y3-202ENST00000427622 2325 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 SLCO1B1-201ENST00000256958 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 OR1E1-201ENST00000322608 1307 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AC005294.1-201ENST00000355509 281 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 MIR589-201ENST00000385238 99 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AL035079.1-201ENST00000405210 287 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 CoTC_ribozyme.1-201ENST00000408104 192 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 MTND2P16-201ENST00000419987 799 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 USP9YP21-201ENST00000420603 432 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AL590730.1-201ENST00000426283 398 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AL136231.1-201ENST00000429407 730 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 LINC02476-202ENST00000431071 559 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 REG1CP-203ENST00000434852 460 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AC234064.1-201ENST00000436312 247 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 OR10R1P-201ENST00000441524 1141 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 RPL7P32-201ENST00000457119 744 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 WDR78-207ENST00000488333 613 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AL365273.2-201ENST00000491114 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 MGAT4A-209ENST00000495056 683 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AC068305.1-201ENST00000497406 726 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AC010395.1-201ENST00000507627 697 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AC093730.1-201ENST00000508825 448 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AC008694.2-201ENST00000517591 306 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AF117829.1-202ENST00000524166 836 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 MTCYBP41-201ENST00000528913 1123 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 OR8I1P-201ENST00000529291 931 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AC008147.1-201ENST00000551284 325 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AC025580.2-202ENST00000558536 715 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 MIR4480-201ENST00000582492 71 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 LINC01835-202ENST00000589345 450 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AC097467.3-209ENST00000595760 615 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 MTRNR2L12-201ENST00000600213 1049 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AC005252.1-201ENST00000604518 1063 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AL390816.3-201ENST00000604527 1066 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 MIR4500HG-205ENST00000606590 579 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AL354760.1-201ENST00000608357 643 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 RMST_9.1-201ENST00000619945 193 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 API5-210ENST00000534600 1760 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 TARID-205ENST00000607033 2960 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 ANGPTL1-202ENST00000367629 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AC117529.2-201ENST00000512159 2068 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 ZNF273-204ENST00000476120 2000 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AC111188.2-201ENST00000529697 1387 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 LINC00474-201ENST00000374014 769 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 RNU1-106P-201ENST00000384382 164 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 BPIFC-202ENST00000397450 458 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 RPL7P27-201ENST00000403775 720 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 FNDC1-IT1-201ENST00000419703 516 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AC079790.1-201ENST00000420365 507 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 UBXN7-204ENST00000428095 1173 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AC124944.2-201ENST00000429866 1242 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 MOB1AP1-201ENST00000430903 535 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 RPL12P17-201ENST00000432393 498 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AP000855.1-201ENST00000433210 636 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 PPIAP17-201ENST00000438507 471 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AC010157.1-201ENST00000440589 527 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 PCBP1-AS1-232ENST00000442040 1111 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AL353743.2-203ENST00000443630 492 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AL160271.1-201ENST00000444708 829 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 VPS29-202ENST00000447578 996 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FOXD4Q12950 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
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