Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 AL445363.3-201ENST00000623080 671 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 AC019278.1-201ENST00000623516 479 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 AC008013.2-202ENST00000637965 364 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 BX649567.1-201ENST00000642071 1134 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 ZNF510-201ENST00000223428 5154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 NAP1L1-204ENST00000535020 1686 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 NRK-204ENST00000540278 1687 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 ENOX2-202ENST00000370927 3788 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 SGO1P1-201ENST00000603525 1447 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 RNMT-203ENST00000543302 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 LGI1-228ENST00000637689 1802 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 TEX35-202ENST00000367639 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 OR6C4-201ENST00000394256 1046 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 MTCO2P31-201ENST00000402702 684 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 AC092638.1-201ENST00000411966 1275 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 AC073071.1-201ENST00000412410 388 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 AL353608.1-201ENST00000419576 416 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 DNAJA1P1-201ENST00000425106 1187 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 AL157831.1-201ENST00000426134 473 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 NPM1P34-201ENST00000428821 893 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 RPS29P17-201ENST00000430795 166 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 AC004875.1-201ENST00000432702 378 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 BX119904.2-201ENST00000446495 512 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 AL360091.1-201ENST00000447949 496 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 AL354771.1-201ENST00000452178 602 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 AC010884.1-201ENST00000456519 642 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 AC004692.2-202ENST00000458680 478 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 NAP1L1P3-201ENST00000462291 880 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 DENND6A-AS1-201ENST00000470427 364 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 AC123768.1-201ENST00000486285 432 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 RN7SL691P-201ENST00000494487 301 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 AC104164.2-201ENST00000496953 495 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 AC008591.1-201ENST00000503616 631 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 AC093903.1-201ENST00000507220 405 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 MTATP6P9-201ENST00000515039 680 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 AC025437.2-201ENST00000518103 548 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 HIGD1AP6-201ENST00000521833 279 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 VNN2-207ENST00000525289 900 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 AP005436.3-201ENST00000532849 572 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 LINC01479-201ENST00000545520 509 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 AC026116.1-201ENST00000551729 474 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 AL352979.3-201ENST00000553515 247 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 YWHAZP1-201ENST00000556286 722 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 NIFKP8-201ENST00000560500 874 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 AC067852.4-201ENST00000590314 478 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 Z82195.1-201ENST00000604558 398 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 AL139022.2-201ENST00000606934 443 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 AC097717.1-250ENST00000608498 273 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 AL359535.1-201ENST00000612100 1087 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
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HOXD13P35453 LINC01625-201ENST00000454788 1690 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
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HOXD13P35453 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
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HOXD13P35453 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 LINC01102-204ENST00000451400 3778 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 AC016716.1-201ENST00000265882 708 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 UBE2Q2P1-202ENST00000354771 883 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 RNU6-1151P-201ENST00000384684 107 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 RPL21P108-201ENST00000413857 481 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 NUP35P2-201ENST00000416748 943 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 AL078581.1-201ENST00000419134 340 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 AC138024.1-201ENST00000420867 699 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 AC005165.1-203ENST00000423689 1281 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 LINC01492-202ENST00000425157 659 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 AF230666.1-201ENST00000429151 786 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 AC131571.1-201ENST00000429821 577 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 AC068287.1-201ENST00000430283 295 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 HSFY7P-201ENST00000432672 318 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 HSFY8P-201ENST00000437934 318 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 HSFY5P-201ENST00000453726 309 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 LINC01753-201ENST00000458145 631 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 RPL23AP24-201ENST00000458203 385 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 HMGB1P38-201ENST00000490557 577 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD13P35453 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
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