Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0G9

Cldn3, Claudin-3, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn3Q9Z0G9 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn3Q9Z0G9 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn3Q9Z0G9 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn3Q9Z0G9 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn3Q9Z0G9 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn3Q9Z0G9 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn3Q9Z0G9 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn3Q9Z0G9 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn3Q9Z0G9 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn3Q9Z0G9 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn3Q9Z0G9 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn3Q9Z0G9 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn3Q9Z0G9 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn3Q9Z0G9 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn3Q9Z0G9 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn3Q9Z0G9 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn3Q9Z0G9 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn3Q9Z0G9 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn3Q9Z0G9 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn3Q9Z0G9 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn3Q9Z0G9 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn3Q9Z0G9 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn3Q9Z0G9 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn3Q9Z0G9 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn3Q9Z0G9 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn3Q9Z0G9 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn3Q9Z0G9 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn3Q9Z0G9 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn3Q9Z0G9 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn3Q9Z0G9 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn3Q9Z0G9 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn3Q9Z0G9 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn3Q9Z0G9 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn3Q9Z0G9 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn3Q9Z0G9 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn3Q9Z0G9 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn3Q9Z0G9 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn3Q9Z0G9 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn3Q9Z0G9 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn3Q9Z0G9 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn3Q9Z0G9 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn3Q9Z0G9 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn3Q9Z0G9 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn3Q9Z0G9 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn3Q9Z0G9 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn3Q9Z0G9 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn3Q9Z0G9 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn3Q9Z0G9 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn3Q9Z0G9 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn3Q9Z0G9 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn3Q9Z0G9 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn3Q9Z0G9 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn3Q9Z0G9 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn3Q9Z0G9 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn3Q9Z0G9 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn3Q9Z0G9 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn3Q9Z0G9 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn3Q9Z0G9 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn3Q9Z0G9 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn3Q9Z0G9 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn3Q9Z0G9 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn3Q9Z0G9 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn3Q9Z0G9 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn3Q9Z0G9 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn3Q9Z0G9 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn3Q9Z0G9 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn3Q9Z0G9 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn3Q9Z0G9 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn3Q9Z0G9 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn3Q9Z0G9 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn3Q9Z0G9 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn3Q9Z0G9 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn3Q9Z0G9 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn3Q9Z0G9 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn3Q9Z0G9 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn3Q9Z0G9 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn3Q9Z0G9 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn3Q9Z0G9 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn3Q9Z0G9 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn3Q9Z0G9 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn3Q9Z0G9 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn3Q9Z0G9 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn3Q9Z0G9 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn3Q9Z0G9 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn3Q9Z0G9 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn3Q9Z0G9 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn3Q9Z0G9 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn3Q9Z0G9 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn3Q9Z0G9 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn3Q9Z0G9 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn3Q9Z0G9 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn3Q9Z0G9 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn3Q9Z0G9 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn3Q9Z0G9 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn3Q9Z0G9 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn3Q9Z0G9 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn3Q9Z0G9 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Cldn3Q9Z0G9 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cldn3Q9Z0G9 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cldn3Q9Z0G9 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms