Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB5

CDH7, Cadherin-7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH7Q9ULB5 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDH7Q9ULB5 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDH7Q9ULB5 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDH7Q9ULB5 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDH7Q9ULB5 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDH7Q9ULB5 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDH7Q9ULB5 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDH7Q9ULB5 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDH7Q9ULB5 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDH7Q9ULB5 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDH7Q9ULB5 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDH7Q9ULB5 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDH7Q9ULB5 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDH7Q9ULB5 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDH7Q9ULB5 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CDH7Q9ULB5 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDH7Q9ULB5 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDH7Q9ULB5 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDH7Q9ULB5 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDH7Q9ULB5 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDH7Q9ULB5 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDH7Q9ULB5 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDH7Q9ULB5 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CDH7Q9ULB5 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDH7Q9ULB5 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDH7Q9ULB5 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDH7Q9ULB5 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDH7Q9ULB5 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDH7Q9ULB5 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDH7Q9ULB5 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CDH7Q9ULB5 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDH7Q9ULB5 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDH7Q9ULB5 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDH7Q9ULB5 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDH7Q9ULB5 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDH7Q9ULB5 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDH7Q9ULB5 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDH7Q9ULB5 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDH7Q9ULB5 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDH7Q9ULB5 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDH7Q9ULB5 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDH7Q9ULB5 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDH7Q9ULB5 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CDH7Q9ULB5 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDH7Q9ULB5 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDH7Q9ULB5 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CDH7Q9ULB5 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CDH7Q9ULB5 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDH7Q9ULB5 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDH7Q9ULB5 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDH7Q9ULB5 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDH7Q9ULB5 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDH7Q9ULB5 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDH7Q9ULB5 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDH7Q9ULB5 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDH7Q9ULB5 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CDH7Q9ULB5 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDH7Q9ULB5 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CDH7Q9ULB5 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDH7Q9ULB5 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDH7Q9ULB5 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDH7Q9ULB5 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDH7Q9ULB5 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDH7Q9ULB5 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDH7Q9ULB5 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDH7Q9ULB5 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDH7Q9ULB5 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDH7Q9ULB5 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDH7Q9ULB5 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDH7Q9ULB5 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDH7Q9ULB5 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDH7Q9ULB5 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CDH7Q9ULB5 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDH7Q9ULB5 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDH7Q9ULB5 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDH7Q9ULB5 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDH7Q9ULB5 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDH7Q9ULB5 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDH7Q9ULB5 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDH7Q9ULB5 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDH7Q9ULB5 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDH7Q9ULB5 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDH7Q9ULB5 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDH7Q9ULB5 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDH7Q9ULB5 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDH7Q9ULB5 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDH7Q9ULB5 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDH7Q9ULB5 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDH7Q9ULB5 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDH7Q9ULB5 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDH7Q9ULB5 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDH7Q9ULB5 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDH7Q9ULB5 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDH7Q9ULB5 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDH7Q9ULB5 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDH7Q9ULB5 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDH7Q9ULB5 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDH7Q9ULB5 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDH7Q9ULB5 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDH7Q9ULB5 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms