Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM93

Arl6ip4, ADP-ribosylation factor-like protein 6-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl6ip4Q9JM93 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arl6ip4Q9JM93 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arl6ip4Q9JM93 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arl6ip4Q9JM93 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arl6ip4Q9JM93 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arl6ip4Q9JM93 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arl6ip4Q9JM93 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arl6ip4Q9JM93 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arl6ip4Q9JM93 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arl6ip4Q9JM93 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arl6ip4Q9JM93 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arl6ip4Q9JM93 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arl6ip4Q9JM93 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arl6ip4Q9JM93 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arl6ip4Q9JM93 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arl6ip4Q9JM93 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arl6ip4Q9JM93 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arl6ip4Q9JM93 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arl6ip4Q9JM93 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Arl6ip4Q9JM93 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arl6ip4Q9JM93 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arl6ip4Q9JM93 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arl6ip4Q9JM93 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arl6ip4Q9JM93 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arl6ip4Q9JM93 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arl6ip4Q9JM93 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arl6ip4Q9JM93 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arl6ip4Q9JM93 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arl6ip4Q9JM93 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arl6ip4Q9JM93 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arl6ip4Q9JM93 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arl6ip4Q9JM93 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arl6ip4Q9JM93 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Arl6ip4Q9JM93 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arl6ip4Q9JM93 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arl6ip4Q9JM93 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arl6ip4Q9JM93 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arl6ip4Q9JM93 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arl6ip4Q9JM93 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arl6ip4Q9JM93 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arl6ip4Q9JM93 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arl6ip4Q9JM93 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arl6ip4Q9JM93 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arl6ip4Q9JM93 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arl6ip4Q9JM93 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arl6ip4Q9JM93 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arl6ip4Q9JM93 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arl6ip4Q9JM93 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arl6ip4Q9JM93 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arl6ip4Q9JM93 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arl6ip4Q9JM93 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arl6ip4Q9JM93 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arl6ip4Q9JM93 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arl6ip4Q9JM93 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arl6ip4Q9JM93 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arl6ip4Q9JM93 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arl6ip4Q9JM93 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arl6ip4Q9JM93 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Arl6ip4Q9JM93 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arl6ip4Q9JM93 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arl6ip4Q9JM93 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arl6ip4Q9JM93 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arl6ip4Q9JM93 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arl6ip4Q9JM93 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arl6ip4Q9JM93 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arl6ip4Q9JM93 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arl6ip4Q9JM93 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arl6ip4Q9JM93 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arl6ip4Q9JM93 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arl6ip4Q9JM93 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arl6ip4Q9JM93 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arl6ip4Q9JM93 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arl6ip4Q9JM93 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arl6ip4Q9JM93 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arl6ip4Q9JM93 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arl6ip4Q9JM93 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arl6ip4Q9JM93 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arl6ip4Q9JM93 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arl6ip4Q9JM93 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Arl6ip4Q9JM93 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arl6ip4Q9JM93 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arl6ip4Q9JM93 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arl6ip4Q9JM93 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arl6ip4Q9JM93 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arl6ip4Q9JM93 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arl6ip4Q9JM93 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arl6ip4Q9JM93 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arl6ip4Q9JM93 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arl6ip4Q9JM93 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arl6ip4Q9JM93 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arl6ip4Q9JM93 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arl6ip4Q9JM93 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arl6ip4Q9JM93 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arl6ip4Q9JM93 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arl6ip4Q9JM93 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arl6ip4Q9JM93 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Arl6ip4Q9JM93 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arl6ip4Q9JM93 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arl6ip4Q9JM93 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arl6ip4Q9JM93 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms