Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nectin3Q9JLB9 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nectin3Q9JLB9 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nectin3Q9JLB9 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nectin3Q9JLB9 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nectin3Q9JLB9 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nectin3Q9JLB9 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nectin3Q9JLB9 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nectin3Q9JLB9 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nectin3Q9JLB9 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nectin3Q9JLB9 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nectin3Q9JLB9 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nectin3Q9JLB9 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nectin3Q9JLB9 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nectin3Q9JLB9 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nectin3Q9JLB9 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nectin3Q9JLB9 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nectin3Q9JLB9 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nectin3Q9JLB9 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nectin3Q9JLB9 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nectin3Q9JLB9 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nectin3Q9JLB9 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nectin3Q9JLB9 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nectin3Q9JLB9 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nectin3Q9JLB9 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nectin3Q9JLB9 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nectin3Q9JLB9 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nectin3Q9JLB9 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nectin3Q9JLB9 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nectin3Q9JLB9 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nectin3Q9JLB9 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nectin3Q9JLB9 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nectin3Q9JLB9 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nectin3Q9JLB9 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nectin3Q9JLB9 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nectin3Q9JLB9 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nectin3Q9JLB9 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nectin3Q9JLB9 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nectin3Q9JLB9 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nectin3Q9JLB9 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nectin3Q9JLB9 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nectin3Q9JLB9 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nectin3Q9JLB9 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nectin3Q9JLB9 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nectin3Q9JLB9 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nectin3Q9JLB9 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nectin3Q9JLB9 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nectin3Q9JLB9 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nectin3Q9JLB9 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nectin3Q9JLB9 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nectin3Q9JLB9 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nectin3Q9JLB9 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nectin3Q9JLB9 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nectin3Q9JLB9 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nectin3Q9JLB9 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nectin3Q9JLB9 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nectin3Q9JLB9 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nectin3Q9JLB9 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nectin3Q9JLB9 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nectin3Q9JLB9 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nectin3Q9JLB9 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nectin3Q9JLB9 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nectin3Q9JLB9 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nectin3Q9JLB9 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nectin3Q9JLB9 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nectin3Q9JLB9 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nectin3Q9JLB9 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nectin3Q9JLB9 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nectin3Q9JLB9 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nectin3Q9JLB9 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nectin3Q9JLB9 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nectin3Q9JLB9 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nectin3Q9JLB9 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nectin3Q9JLB9 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nectin3Q9JLB9 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nectin3Q9JLB9 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nectin3Q9JLB9 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nectin3Q9JLB9 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nectin3Q9JLB9 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nectin3Q9JLB9 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nectin3Q9JLB9 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nectin3Q9JLB9 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nectin3Q9JLB9 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nectin3Q9JLB9 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nectin3Q9JLB9 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nectin3Q9JLB9 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nectin3Q9JLB9 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nectin3Q9JLB9 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nectin3Q9JLB9 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nectin3Q9JLB9 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nectin3Q9JLB9 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nectin3Q9JLB9 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nectin3Q9JLB9 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nectin3Q9JLB9 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nectin3Q9JLB9 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nectin3Q9JLB9 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nectin3Q9JLB9 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nectin3Q9JLB9 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nectin3Q9JLB9 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nectin3Q9JLB9 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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