Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER88

Dap3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dap3Q9ER88 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms