Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9N5

Cib4, Calcium and integrin-binding family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib4Q9D9N5 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cib4Q9D9N5 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cib4Q9D9N5 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cib4Q9D9N5 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cib4Q9D9N5 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cib4Q9D9N5 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cib4Q9D9N5 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cib4Q9D9N5 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cib4Q9D9N5 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cib4Q9D9N5 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cib4Q9D9N5 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cib4Q9D9N5 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cib4Q9D9N5 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cib4Q9D9N5 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cib4Q9D9N5 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cib4Q9D9N5 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cib4Q9D9N5 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cib4Q9D9N5 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cib4Q9D9N5 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cib4Q9D9N5 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cib4Q9D9N5 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cib4Q9D9N5 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cib4Q9D9N5 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cib4Q9D9N5 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cib4Q9D9N5 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cib4Q9D9N5 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cib4Q9D9N5 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cib4Q9D9N5 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cib4Q9D9N5 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cib4Q9D9N5 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cib4Q9D9N5 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cib4Q9D9N5 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cib4Q9D9N5 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cib4Q9D9N5 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cib4Q9D9N5 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cib4Q9D9N5 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cib4Q9D9N5 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cib4Q9D9N5 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cib4Q9D9N5 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cib4Q9D9N5 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cib4Q9D9N5 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cib4Q9D9N5 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cib4Q9D9N5 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cib4Q9D9N5 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cib4Q9D9N5 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cib4Q9D9N5 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cib4Q9D9N5 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cib4Q9D9N5 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cib4Q9D9N5 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cib4Q9D9N5 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cib4Q9D9N5 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cib4Q9D9N5 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cib4Q9D9N5 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cib4Q9D9N5 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cib4Q9D9N5 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cib4Q9D9N5 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cib4Q9D9N5 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cib4Q9D9N5 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cib4Q9D9N5 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cib4Q9D9N5 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cib4Q9D9N5 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cib4Q9D9N5 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cib4Q9D9N5 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cib4Q9D9N5 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cib4Q9D9N5 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cib4Q9D9N5 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cib4Q9D9N5 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cib4Q9D9N5 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cib4Q9D9N5 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cib4Q9D9N5 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cib4Q9D9N5 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cib4Q9D9N5 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cib4Q9D9N5 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cib4Q9D9N5 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cib4Q9D9N5 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cib4Q9D9N5 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cib4Q9D9N5 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cib4Q9D9N5 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cib4Q9D9N5 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cib4Q9D9N5 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cib4Q9D9N5 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cib4Q9D9N5 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cib4Q9D9N5 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cib4Q9D9N5 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cib4Q9D9N5 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cib4Q9D9N5 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cib4Q9D9N5 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cib4Q9D9N5 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cib4Q9D9N5 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cib4Q9D9N5 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cib4Q9D9N5 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cib4Q9D9N5 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cib4Q9D9N5 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cib4Q9D9N5 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cib4Q9D9N5 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cib4Q9D9N5 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cib4Q9D9N5 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cib4Q9D9N5 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cib4Q9D9N5 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cib4Q9D9N5 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms