Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms