Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7X1

Kctd4, BTB/POZ domain-containing protein KCTD4, mousemouse

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kctd4Q9D7X1 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kctd4Q9D7X1 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kctd4Q9D7X1 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kctd4Q9D7X1 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kctd4Q9D7X1 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kctd4Q9D7X1 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kctd4Q9D7X1 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kctd4Q9D7X1 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kctd4Q9D7X1 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kctd4Q9D7X1 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kctd4Q9D7X1 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kctd4Q9D7X1 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kctd4Q9D7X1 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kctd4Q9D7X1 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kctd4Q9D7X1 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kctd4Q9D7X1 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kctd4Q9D7X1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Kctd4Q9D7X1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Kctd4Q9D7X1 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Kctd4Q9D7X1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Kctd4Q9D7X1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kctd4Q9D7X1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kctd4Q9D7X1 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kctd4Q9D7X1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kctd4Q9D7X1 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kctd4Q9D7X1 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kctd4Q9D7X1 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kctd4Q9D7X1 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kctd4Q9D7X1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kctd4Q9D7X1 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kctd4Q9D7X1 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kctd4Q9D7X1 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kctd4Q9D7X1 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kctd4Q9D7X1 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kctd4Q9D7X1 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kctd4Q9D7X1 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kctd4Q9D7X1 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kctd4Q9D7X1 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kctd4Q9D7X1 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kctd4Q9D7X1 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kctd4Q9D7X1 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kctd4Q9D7X1 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kctd4Q9D7X1 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kctd4Q9D7X1 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kctd4Q9D7X1 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kctd4Q9D7X1 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kctd4Q9D7X1 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kctd4Q9D7X1 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Kctd4Q9D7X1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kctd4Q9D7X1 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kctd4Q9D7X1 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kctd4Q9D7X1 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kctd4Q9D7X1 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Kctd4Q9D7X1 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kctd4Q9D7X1 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kctd4Q9D7X1 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kctd4Q9D7X1 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kctd4Q9D7X1 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kctd4Q9D7X1 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kctd4Q9D7X1 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Kctd4Q9D7X1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kctd4Q9D7X1 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kctd4Q9D7X1 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kctd4Q9D7X1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kctd4Q9D7X1 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kctd4Q9D7X1 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kctd4Q9D7X1 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kctd4Q9D7X1 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kctd4Q9D7X1 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kctd4Q9D7X1 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kctd4Q9D7X1 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kctd4Q9D7X1 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kctd4Q9D7X1 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Kctd4Q9D7X1 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kctd4Q9D7X1 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kctd4Q9D7X1 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kctd4Q9D7X1 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kctd4Q9D7X1 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kctd4Q9D7X1 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kctd4Q9D7X1 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kctd4Q9D7X1 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kctd4Q9D7X1 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kctd4Q9D7X1 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Kctd4Q9D7X1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kctd4Q9D7X1 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kctd4Q9D7X1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kctd4Q9D7X1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kctd4Q9D7X1 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kctd4Q9D7X1 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kctd4Q9D7X1 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kctd4Q9D7X1 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kctd4Q9D7X1 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kctd4Q9D7X1 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kctd4Q9D7X1 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kctd4Q9D7X1 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kctd4Q9D7X1 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kctd4Q9D7X1 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kctd4Q9D7X1 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kctd4Q9D7X1 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kctd4Q9D7X1 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms