Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT8

Rab3b, Ras-related protein Rab-3B, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3bQ9CZT8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab3bQ9CZT8 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab3bQ9CZT8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab3bQ9CZT8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab3bQ9CZT8 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab3bQ9CZT8 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab3bQ9CZT8 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab3bQ9CZT8 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab3bQ9CZT8 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab3bQ9CZT8 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab3bQ9CZT8 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab3bQ9CZT8 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab3bQ9CZT8 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab3bQ9CZT8 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms