Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

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Length 349 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Xrcc3Q9CXE6 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Xrcc3Q9CXE6 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Xrcc3Q9CXE6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Xrcc3Q9CXE6 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Xrcc3Q9CXE6 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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