Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Atp6v0e1Q9CQD8 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Atp6v0e1Q9CQD8 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Atp6v0e1Q9CQD8 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Atp6v0e1Q9CQD8 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
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Atp6v0e1Q9CQD8 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Atp6v0e1Q9CQD8 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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