Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chmp3Q9CQ10 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chmp3Q9CQ10 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Chmp3Q9CQ10 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chmp3Q9CQ10 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chmp3Q9CQ10 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chmp3Q9CQ10 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chmp3Q9CQ10 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chmp3Q9CQ10 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chmp3Q9CQ10 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chmp3Q9CQ10 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chmp3Q9CQ10 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chmp3Q9CQ10 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chmp3Q9CQ10 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chmp3Q9CQ10 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chmp3Q9CQ10 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chmp3Q9CQ10 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chmp3Q9CQ10 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chmp3Q9CQ10 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chmp3Q9CQ10 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chmp3Q9CQ10 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chmp3Q9CQ10 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chmp3Q9CQ10 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chmp3Q9CQ10 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chmp3Q9CQ10 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chmp3Q9CQ10 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chmp3Q9CQ10 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Chmp3Q9CQ10 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chmp3Q9CQ10 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chmp3Q9CQ10 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chmp3Q9CQ10 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chmp3Q9CQ10 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chmp3Q9CQ10 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chmp3Q9CQ10 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chmp3Q9CQ10 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chmp3Q9CQ10 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chmp3Q9CQ10 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chmp3Q9CQ10 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chmp3Q9CQ10 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chmp3Q9CQ10 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chmp3Q9CQ10 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chmp3Q9CQ10 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Chmp3Q9CQ10 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chmp3Q9CQ10 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chmp3Q9CQ10 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chmp3Q9CQ10 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chmp3Q9CQ10 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chmp3Q9CQ10 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Chmp3Q9CQ10 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chmp3Q9CQ10 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chmp3Q9CQ10 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chmp3Q9CQ10 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chmp3Q9CQ10 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chmp3Q9CQ10 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chmp3Q9CQ10 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chmp3Q9CQ10 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chmp3Q9CQ10 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chmp3Q9CQ10 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chmp3Q9CQ10 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chmp3Q9CQ10 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chmp3Q9CQ10 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chmp3Q9CQ10 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chmp3Q9CQ10 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chmp3Q9CQ10 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chmp3Q9CQ10 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chmp3Q9CQ10 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chmp3Q9CQ10 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chmp3Q9CQ10 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Chmp3Q9CQ10 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Chmp3Q9CQ10 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Chmp3Q9CQ10 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Chmp3Q9CQ10 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Chmp3Q9CQ10 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Chmp3Q9CQ10 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Chmp3Q9CQ10 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Chmp3Q9CQ10 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Chmp3Q9CQ10 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Chmp3Q9CQ10 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Chmp3Q9CQ10 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Chmp3Q9CQ10 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Chmp3Q9CQ10 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Chmp3Q9CQ10 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chmp3Q9CQ10 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chmp3Q9CQ10 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chmp3Q9CQ10 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chmp3Q9CQ10 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chmp3Q9CQ10 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chmp3Q9CQ10 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chmp3Q9CQ10 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chmp3Q9CQ10 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chmp3Q9CQ10 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Chmp3Q9CQ10 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chmp3Q9CQ10 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chmp3Q9CQ10 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chmp3Q9CQ10 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chmp3Q9CQ10 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chmp3Q9CQ10 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chmp3Q9CQ10 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chmp3Q9CQ10 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chmp3Q9CQ10 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms