Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE6

Abcf2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf2Q99LE6 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Abcf2Q99LE6 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms