Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LMTK3Q96Q04 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LMTK3Q96Q04 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LMTK3Q96Q04 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LMTK3Q96Q04 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
LMTK3Q96Q04 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
LMTK3Q96Q04 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LMTK3Q96Q04 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LMTK3Q96Q04 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LMTK3Q96Q04 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LMTK3Q96Q04 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LMTK3Q96Q04 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LMTK3Q96Q04 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LMTK3Q96Q04 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LMTK3Q96Q04 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LMTK3Q96Q04 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LMTK3Q96Q04 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LMTK3Q96Q04 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
LMTK3Q96Q04 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LMTK3Q96Q04 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LMTK3Q96Q04 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LMTK3Q96Q04 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LMTK3Q96Q04 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LMTK3Q96Q04 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LMTK3Q96Q04 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LMTK3Q96Q04 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LMTK3Q96Q04 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LMTK3Q96Q04 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LMTK3Q96Q04 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LMTK3Q96Q04 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LMTK3Q96Q04 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
LMTK3Q96Q04 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
LMTK3Q96Q04 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
LMTK3Q96Q04 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.04
LMTK3Q96Q04 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
LMTK3Q96Q04 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.04
LMTK3Q96Q04 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.04
LMTK3Q96Q04 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC27.83■■■□□ 2.04
LMTK3Q96Q04 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LMTK3Q96Q04 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LMTK3Q96Q04 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LMTK3Q96Q04 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LMTK3Q96Q04 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LMTK3Q96Q04 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LMTK3Q96Q04 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LMTK3Q96Q04 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
LMTK3Q96Q04 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LMTK3Q96Q04 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LMTK3Q96Q04 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LMTK3Q96Q04 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LMTK3Q96Q04 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LMTK3Q96Q04 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LMTK3Q96Q04 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LMTK3Q96Q04 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LMTK3Q96Q04 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LMTK3Q96Q04 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LMTK3Q96Q04 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
LMTK3Q96Q04 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
LMTK3Q96Q04 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LMTK3Q96Q04 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LMTK3Q96Q04 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LMTK3Q96Q04 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LMTK3Q96Q04 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LMTK3Q96Q04 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LMTK3Q96Q04 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LMTK3Q96Q04 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LMTK3Q96Q04 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LMTK3Q96Q04 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LMTK3Q96Q04 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LMTK3Q96Q04 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
LMTK3Q96Q04 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LMTK3Q96Q04 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
LMTK3Q96Q04 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LMTK3Q96Q04 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LMTK3Q96Q04 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LMTK3Q96Q04 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LMTK3Q96Q04 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
LMTK3Q96Q04 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LMTK3Q96Q04 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LMTK3Q96Q04 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LMTK3Q96Q04 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LMTK3Q96Q04 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LMTK3Q96Q04 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LMTK3Q96Q04 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LMTK3Q96Q04 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LMTK3Q96Q04 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
LMTK3Q96Q04 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LMTK3Q96Q04 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LMTK3Q96Q04 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LMTK3Q96Q04 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
LMTK3Q96Q04 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LMTK3Q96Q04 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LMTK3Q96Q04 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LMTK3Q96Q04 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LMTK3Q96Q04 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LMTK3Q96Q04 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LMTK3Q96Q04 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LMTK3Q96Q04 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LMTK3Q96Q04 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LMTK3Q96Q04 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms