Protein–RNA interactions for Protein: Q8VED5

Krt79, Keratin, type II cytoskeletal 79, mousemouse

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Length 531 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt79Q8VED5 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt79Q8VED5 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt79Q8VED5 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt79Q8VED5 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt79Q8VED5 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt79Q8VED5 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt79Q8VED5 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt79Q8VED5 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt79Q8VED5 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt79Q8VED5 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt79Q8VED5 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt79Q8VED5 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt79Q8VED5 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt79Q8VED5 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt79Q8VED5 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt79Q8VED5 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt79Q8VED5 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt79Q8VED5 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt79Q8VED5 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt79Q8VED5 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt79Q8VED5 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt79Q8VED5 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt79Q8VED5 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt79Q8VED5 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt79Q8VED5 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt79Q8VED5 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt79Q8VED5 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt79Q8VED5 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt79Q8VED5 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt79Q8VED5 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt79Q8VED5 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt79Q8VED5 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt79Q8VED5 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt79Q8VED5 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt79Q8VED5 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt79Q8VED5 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt79Q8VED5 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt79Q8VED5 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Krt79Q8VED5 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt79Q8VED5 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt79Q8VED5 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt79Q8VED5 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt79Q8VED5 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt79Q8VED5 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt79Q8VED5 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt79Q8VED5 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt79Q8VED5 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt79Q8VED5 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt79Q8VED5 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt79Q8VED5 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt79Q8VED5 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt79Q8VED5 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt79Q8VED5 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt79Q8VED5 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt79Q8VED5 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt79Q8VED5 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Krt79Q8VED5 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt79Q8VED5 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt79Q8VED5 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt79Q8VED5 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt79Q8VED5 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt79Q8VED5 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Krt79Q8VED5 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Krt79Q8VED5 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt79Q8VED5 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt79Q8VED5 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt79Q8VED5 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt79Q8VED5 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt79Q8VED5 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt79Q8VED5 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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Krt79Q8VED5 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt79Q8VED5 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt79Q8VED5 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt79Q8VED5 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt79Q8VED5 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt79Q8VED5 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt79Q8VED5 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt79Q8VED5 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt79Q8VED5 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt79Q8VED5 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt79Q8VED5 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt79Q8VED5 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt79Q8VED5 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt79Q8VED5 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt79Q8VED5 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt79Q8VED5 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt79Q8VED5 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt79Q8VED5 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt79Q8VED5 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms