Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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