Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHT1

Ngef, Ephexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgefQ8CHT1 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NgefQ8CHT1 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NgefQ8CHT1 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NgefQ8CHT1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NgefQ8CHT1 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NgefQ8CHT1 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NgefQ8CHT1 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NgefQ8CHT1 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NgefQ8CHT1 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NgefQ8CHT1 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NgefQ8CHT1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NgefQ8CHT1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NgefQ8CHT1 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NgefQ8CHT1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NgefQ8CHT1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NgefQ8CHT1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NgefQ8CHT1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NgefQ8CHT1 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NgefQ8CHT1 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NgefQ8CHT1 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NgefQ8CHT1 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NgefQ8CHT1 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NgefQ8CHT1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NgefQ8CHT1 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NgefQ8CHT1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NgefQ8CHT1 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NgefQ8CHT1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NgefQ8CHT1 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NgefQ8CHT1 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NgefQ8CHT1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NgefQ8CHT1 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NgefQ8CHT1 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NgefQ8CHT1 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NgefQ8CHT1 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NgefQ8CHT1 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NgefQ8CHT1 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NgefQ8CHT1 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NgefQ8CHT1 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NgefQ8CHT1 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NgefQ8CHT1 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NgefQ8CHT1 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NgefQ8CHT1 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NgefQ8CHT1 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NgefQ8CHT1 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NgefQ8CHT1 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NgefQ8CHT1 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NgefQ8CHT1 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NgefQ8CHT1 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NgefQ8CHT1 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NgefQ8CHT1 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NgefQ8CHT1 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NgefQ8CHT1 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NgefQ8CHT1 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NgefQ8CHT1 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NgefQ8CHT1 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NgefQ8CHT1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NgefQ8CHT1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NgefQ8CHT1 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NgefQ8CHT1 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NgefQ8CHT1 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NgefQ8CHT1 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NgefQ8CHT1 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NgefQ8CHT1 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NgefQ8CHT1 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NgefQ8CHT1 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NgefQ8CHT1 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NgefQ8CHT1 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NgefQ8CHT1 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NgefQ8CHT1 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NgefQ8CHT1 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NgefQ8CHT1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NgefQ8CHT1 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NgefQ8CHT1 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NgefQ8CHT1 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NgefQ8CHT1 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NgefQ8CHT1 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NgefQ8CHT1 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NgefQ8CHT1 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NgefQ8CHT1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NgefQ8CHT1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NgefQ8CHT1 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NgefQ8CHT1 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NgefQ8CHT1 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NgefQ8CHT1 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NgefQ8CHT1 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NgefQ8CHT1 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NgefQ8CHT1 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NgefQ8CHT1 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NgefQ8CHT1 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NgefQ8CHT1 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NgefQ8CHT1 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NgefQ8CHT1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NgefQ8CHT1 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NgefQ8CHT1 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NgefQ8CHT1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NgefQ8CHT1 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
NgefQ8CHT1 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
NgefQ8CHT1 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NgefQ8CHT1 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NgefQ8CHT1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms