Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUM3

Ptpn7, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 7, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn7Q8BUM3 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptpn7Q8BUM3 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptpn7Q8BUM3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptpn7Q8BUM3 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptpn7Q8BUM3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn7Q8BUM3 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn7Q8BUM3 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn7Q8BUM3 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn7Q8BUM3 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn7Q8BUM3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn7Q8BUM3 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn7Q8BUM3 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn7Q8BUM3 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn7Q8BUM3 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn7Q8BUM3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn7Q8BUM3 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn7Q8BUM3 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn7Q8BUM3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn7Q8BUM3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn7Q8BUM3 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn7Q8BUM3 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn7Q8BUM3 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn7Q8BUM3 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn7Q8BUM3 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn7Q8BUM3 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn7Q8BUM3 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn7Q8BUM3 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn7Q8BUM3 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn7Q8BUM3 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn7Q8BUM3 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn7Q8BUM3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn7Q8BUM3 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn7Q8BUM3 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn7Q8BUM3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn7Q8BUM3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn7Q8BUM3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn7Q8BUM3 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn7Q8BUM3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn7Q8BUM3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn7Q8BUM3 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn7Q8BUM3 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn7Q8BUM3 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn7Q8BUM3 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn7Q8BUM3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn7Q8BUM3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn7Q8BUM3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn7Q8BUM3 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn7Q8BUM3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn7Q8BUM3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn7Q8BUM3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn7Q8BUM3 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn7Q8BUM3 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn7Q8BUM3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn7Q8BUM3 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn7Q8BUM3 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn7Q8BUM3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn7Q8BUM3 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn7Q8BUM3 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn7Q8BUM3 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn7Q8BUM3 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn7Q8BUM3 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn7Q8BUM3 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn7Q8BUM3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn7Q8BUM3 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn7Q8BUM3 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn7Q8BUM3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn7Q8BUM3 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn7Q8BUM3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn7Q8BUM3 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn7Q8BUM3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn7Q8BUM3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn7Q8BUM3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn7Q8BUM3 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn7Q8BUM3 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn7Q8BUM3 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn7Q8BUM3 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn7Q8BUM3 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn7Q8BUM3 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn7Q8BUM3 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn7Q8BUM3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn7Q8BUM3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn7Q8BUM3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn7Q8BUM3 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn7Q8BUM3 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn7Q8BUM3 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptpn7Q8BUM3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn7Q8BUM3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn7Q8BUM3 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn7Q8BUM3 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn7Q8BUM3 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn7Q8BUM3 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn7Q8BUM3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn7Q8BUM3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn7Q8BUM3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn7Q8BUM3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn7Q8BUM3 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn7Q8BUM3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn7Q8BUM3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn7Q8BUM3 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptpn7Q8BUM3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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