Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot1Q6ZQ08 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms