Protein–RNA interactions for Protein: Q62443

Nptx1, Neuronal pentraxin-1, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx1Q62443 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
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Nptx1Q62443 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nptx1Q62443 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nptx1Q62443 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Nptx1Q62443 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nptx1Q62443 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nptx1Q62443 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nptx1Q62443 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nptx1Q62443 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nptx1Q62443 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Nptx1Q62443 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nptx1Q62443 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Nptx1Q62443 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nptx1Q62443 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nptx1Q62443 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nptx1Q62443 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nptx1Q62443 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Nptx1Q62443 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Nptx1Q62443 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Nptx1Q62443 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Nptx1Q62443 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nptx1Q62443 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nptx1Q62443 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nptx1Q62443 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nptx1Q62443 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Nptx1Q62443 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nptx1Q62443 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Nptx1Q62443 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nptx1Q62443 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nptx1Q62443 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Nptx1Q62443 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Nptx1Q62443 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nptx1Q62443 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nptx1Q62443 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nptx1Q62443 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Nptx1Q62443 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nptx1Q62443 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nptx1Q62443 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nptx1Q62443 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nptx1Q62443 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nptx1Q62443 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Nptx1Q62443 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Nptx1Q62443 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Nptx1Q62443 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Nptx1Q62443 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Nptx1Q62443 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nptx1Q62443 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nptx1Q62443 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nptx1Q62443 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Nptx1Q62443 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Nptx1Q62443 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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