Protein–RNA interactions for Protein: Q60641

Nr1h4, Bile acid receptor, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1h4Q60641 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nr1h4Q60641 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nr1h4Q60641 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nr1h4Q60641 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nr1h4Q60641 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nr1h4Q60641 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nr1h4Q60641 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr1h4Q60641 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr1h4Q60641 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr1h4Q60641 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr1h4Q60641 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr1h4Q60641 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr1h4Q60641 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr1h4Q60641 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr1h4Q60641 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr1h4Q60641 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr1h4Q60641 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr1h4Q60641 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr1h4Q60641 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr1h4Q60641 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr1h4Q60641 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr1h4Q60641 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr1h4Q60641 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr1h4Q60641 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr1h4Q60641 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr1h4Q60641 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr1h4Q60641 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr1h4Q60641 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr1h4Q60641 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr1h4Q60641 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr1h4Q60641 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr1h4Q60641 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr1h4Q60641 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr1h4Q60641 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr1h4Q60641 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr1h4Q60641 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr1h4Q60641 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr1h4Q60641 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr1h4Q60641 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr1h4Q60641 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr1h4Q60641 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr1h4Q60641 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr1h4Q60641 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr1h4Q60641 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr1h4Q60641 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr1h4Q60641 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr1h4Q60641 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr1h4Q60641 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nr1h4Q60641 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nr1h4Q60641 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nr1h4Q60641 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nr1h4Q60641 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nr1h4Q60641 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nr1h4Q60641 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nr1h4Q60641 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nr1h4Q60641 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nr1h4Q60641 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr1h4Q60641 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr1h4Q60641 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr1h4Q60641 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr1h4Q60641 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr1h4Q60641 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr1h4Q60641 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr1h4Q60641 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr1h4Q60641 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr1h4Q60641 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr1h4Q60641 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr1h4Q60641 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr1h4Q60641 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr1h4Q60641 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr1h4Q60641 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr1h4Q60641 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr1h4Q60641 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr1h4Q60641 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr1h4Q60641 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr1h4Q60641 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr1h4Q60641 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr1h4Q60641 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr1h4Q60641 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr1h4Q60641 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr1h4Q60641 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr1h4Q60641 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr1h4Q60641 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr1h4Q60641 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr1h4Q60641 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr1h4Q60641 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr1h4Q60641 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr1h4Q60641 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr1h4Q60641 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr1h4Q60641 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr1h4Q60641 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr1h4Q60641 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr1h4Q60641 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr1h4Q60641 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr1h4Q60641 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr1h4Q60641 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr1h4Q60641 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr1h4Q60641 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr1h4Q60641 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr1h4Q60641 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms