Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUE8

Ankrd40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd40Q5SUE8 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ankrd40Q5SUE8 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ankrd40Q5SUE8 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ankrd40Q5SUE8 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ankrd40Q5SUE8 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ankrd40Q5SUE8 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ankrd40Q5SUE8 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ankrd40Q5SUE8 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ankrd40Q5SUE8 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ankrd40Q5SUE8 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ankrd40Q5SUE8 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ankrd40Q5SUE8 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ankrd40Q5SUE8 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ankrd40Q5SUE8 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ankrd40Q5SUE8 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ankrd40Q5SUE8 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ankrd40Q5SUE8 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ankrd40Q5SUE8 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ankrd40Q5SUE8 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ankrd40Q5SUE8 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ankrd40Q5SUE8 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ankrd40Q5SUE8 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ankrd40Q5SUE8 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ankrd40Q5SUE8 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ankrd40Q5SUE8 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ankrd40Q5SUE8 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ankrd40Q5SUE8 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ankrd40Q5SUE8 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ankrd40Q5SUE8 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ankrd40Q5SUE8 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ankrd40Q5SUE8 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ankrd40Q5SUE8 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ankrd40Q5SUE8 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ankrd40Q5SUE8 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ankrd40Q5SUE8 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ankrd40Q5SUE8 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ankrd40Q5SUE8 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ankrd40Q5SUE8 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ankrd40Q5SUE8 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ankrd40Q5SUE8 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ankrd40Q5SUE8 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ankrd40Q5SUE8 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ankrd40Q5SUE8 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ankrd40Q5SUE8 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ankrd40Q5SUE8 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ankrd40Q5SUE8 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ankrd40Q5SUE8 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ankrd40Q5SUE8 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ankrd40Q5SUE8 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ankrd40Q5SUE8 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ankrd40Q5SUE8 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ankrd40Q5SUE8 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ankrd40Q5SUE8 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ankrd40Q5SUE8 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ankrd40Q5SUE8 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ankrd40Q5SUE8 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ankrd40Q5SUE8 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ankrd40Q5SUE8 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ankrd40Q5SUE8 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ankrd40Q5SUE8 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ankrd40Q5SUE8 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ankrd40Q5SUE8 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ankrd40Q5SUE8 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ankrd40Q5SUE8 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ankrd40Q5SUE8 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ankrd40Q5SUE8 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ankrd40Q5SUE8 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ankrd40Q5SUE8 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ankrd40Q5SUE8 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ankrd40Q5SUE8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ankrd40Q5SUE8 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ankrd40Q5SUE8 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ankrd40Q5SUE8 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ankrd40Q5SUE8 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ankrd40Q5SUE8 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ankrd40Q5SUE8 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ankrd40Q5SUE8 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ankrd40Q5SUE8 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ankrd40Q5SUE8 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ankrd40Q5SUE8 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ankrd40Q5SUE8 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ankrd40Q5SUE8 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ankrd40Q5SUE8 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ankrd40Q5SUE8 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ankrd40Q5SUE8 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ankrd40Q5SUE8 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ankrd40Q5SUE8 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ankrd40Q5SUE8 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ankrd40Q5SUE8 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ankrd40Q5SUE8 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ankrd40Q5SUE8 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ankrd40Q5SUE8 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ankrd40Q5SUE8 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ankrd40Q5SUE8 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ankrd40Q5SUE8 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ankrd40Q5SUE8 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ankrd40Q5SUE8 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ankrd40Q5SUE8 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ankrd40Q5SUE8 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ankrd40Q5SUE8 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms