Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCB3

Gm5431, Predicted gene 5431, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5431Q5NCB3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5431Q5NCB3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5431Q5NCB3 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5431Q5NCB3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5431Q5NCB3 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5431Q5NCB3 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5431Q5NCB3 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5431Q5NCB3 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5431Q5NCB3 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5431Q5NCB3 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5431Q5NCB3 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5431Q5NCB3 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm5431Q5NCB3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm5431Q5NCB3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm5431Q5NCB3 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm5431Q5NCB3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm5431Q5NCB3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm5431Q5NCB3 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm5431Q5NCB3 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm5431Q5NCB3 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5431Q5NCB3 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5431Q5NCB3 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5431Q5NCB3 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5431Q5NCB3 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5431Q5NCB3 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5431Q5NCB3 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5431Q5NCB3 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5431Q5NCB3 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5431Q5NCB3 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5431Q5NCB3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5431Q5NCB3 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5431Q5NCB3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5431Q5NCB3 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5431Q5NCB3 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5431Q5NCB3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5431Q5NCB3 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5431Q5NCB3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5431Q5NCB3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5431Q5NCB3 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5431Q5NCB3 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5431Q5NCB3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5431Q5NCB3 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5431Q5NCB3 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5431Q5NCB3 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5431Q5NCB3 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5431Q5NCB3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5431Q5NCB3 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5431Q5NCB3 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5431Q5NCB3 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5431Q5NCB3 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5431Q5NCB3 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5431Q5NCB3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5431Q5NCB3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5431Q5NCB3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5431Q5NCB3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5431Q5NCB3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5431Q5NCB3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5431Q5NCB3 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5431Q5NCB3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5431Q5NCB3 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5431Q5NCB3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5431Q5NCB3 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5431Q5NCB3 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5431Q5NCB3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5431Q5NCB3 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5431Q5NCB3 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5431Q5NCB3 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5431Q5NCB3 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5431Q5NCB3 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5431Q5NCB3 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5431Q5NCB3 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5431Q5NCB3 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5431Q5NCB3 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5431Q5NCB3 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5431Q5NCB3 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5431Q5NCB3 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5431Q5NCB3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5431Q5NCB3 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5431Q5NCB3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5431Q5NCB3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5431Q5NCB3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5431Q5NCB3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5431Q5NCB3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5431Q5NCB3 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5431Q5NCB3 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5431Q5NCB3 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5431Q5NCB3 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5431Q5NCB3 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5431Q5NCB3 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5431Q5NCB3 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5431Q5NCB3 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5431Q5NCB3 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5431Q5NCB3 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5431Q5NCB3 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5431Q5NCB3 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5431Q5NCB3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5431Q5NCB3 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5431Q5NCB3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5431Q5NCB3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5431Q5NCB3 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms