Protein–RNA interactions for Protein: Q3URY0

Rtl4, Retrotransposon Gag-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rtl4Q3URY0 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rtl4Q3URY0 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Rtl4Q3URY0 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Rtl4Q3URY0 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Rtl4Q3URY0 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Rtl4Q3URY0 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rtl4Q3URY0 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Rtl4Q3URY0 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rtl4Q3URY0 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Rtl4Q3URY0 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Rtl4Q3URY0 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rtl4Q3URY0 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rtl4Q3URY0 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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