Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
E130208F15RikQ3UPV3 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms