Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULM0

Ccdc106, Coiled-coil domain-containing protein 106, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc106Q3ULM0 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc106Q3ULM0 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc106Q3ULM0 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc106Q3ULM0 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc106Q3ULM0 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc106Q3ULM0 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc106Q3ULM0 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc106Q3ULM0 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc106Q3ULM0 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc106Q3ULM0 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc106Q3ULM0 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc106Q3ULM0 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc106Q3ULM0 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc106Q3ULM0 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc106Q3ULM0 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc106Q3ULM0 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc106Q3ULM0 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc106Q3ULM0 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc106Q3ULM0 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc106Q3ULM0 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc106Q3ULM0 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc106Q3ULM0 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc106Q3ULM0 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc106Q3ULM0 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc106Q3ULM0 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc106Q3ULM0 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc106Q3ULM0 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc106Q3ULM0 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc106Q3ULM0 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc106Q3ULM0 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc106Q3ULM0 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc106Q3ULM0 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc106Q3ULM0 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc106Q3ULM0 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc106Q3ULM0 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc106Q3ULM0 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc106Q3ULM0 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc106Q3ULM0 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc106Q3ULM0 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc106Q3ULM0 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc106Q3ULM0 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc106Q3ULM0 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc106Q3ULM0 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc106Q3ULM0 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc106Q3ULM0 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc106Q3ULM0 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc106Q3ULM0 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc106Q3ULM0 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc106Q3ULM0 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc106Q3ULM0 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc106Q3ULM0 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc106Q3ULM0 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc106Q3ULM0 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc106Q3ULM0 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc106Q3ULM0 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc106Q3ULM0 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc106Q3ULM0 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc106Q3ULM0 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc106Q3ULM0 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc106Q3ULM0 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc106Q3ULM0 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc106Q3ULM0 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc106Q3ULM0 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc106Q3ULM0 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc106Q3ULM0 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc106Q3ULM0 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc106Q3ULM0 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc106Q3ULM0 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc106Q3ULM0 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc106Q3ULM0 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc106Q3ULM0 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc106Q3ULM0 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc106Q3ULM0 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc106Q3ULM0 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc106Q3ULM0 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc106Q3ULM0 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc106Q3ULM0 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc106Q3ULM0 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc106Q3ULM0 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc106Q3ULM0 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc106Q3ULM0 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc106Q3ULM0 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc106Q3ULM0 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc106Q3ULM0 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc106Q3ULM0 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc106Q3ULM0 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc106Q3ULM0 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc106Q3ULM0 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc106Q3ULM0 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc106Q3ULM0 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc106Q3ULM0 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc106Q3ULM0 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc106Q3ULM0 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc106Q3ULM0 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc106Q3ULM0 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc106Q3ULM0 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc106Q3ULM0 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc106Q3ULM0 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc106Q3ULM0 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc106Q3ULM0 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms