Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab42Q0PD08 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab42Q0PD08 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab42Q0PD08 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab42Q0PD08 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab42Q0PD08 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab42Q0PD08 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab42Q0PD08 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab42Q0PD08 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab42Q0PD08 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab42Q0PD08 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab42Q0PD08 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab42Q0PD08 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab42Q0PD08 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab42Q0PD08 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab42Q0PD08 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab42Q0PD08 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab42Q0PD08 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab42Q0PD08 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab42Q0PD08 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab42Q0PD08 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab42Q0PD08 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab42Q0PD08 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab42Q0PD08 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab42Q0PD08 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab42Q0PD08 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab42Q0PD08 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab42Q0PD08 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab42Q0PD08 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab42Q0PD08 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab42Q0PD08 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab42Q0PD08 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab42Q0PD08 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab42Q0PD08 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab42Q0PD08 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab42Q0PD08 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab42Q0PD08 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab42Q0PD08 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab42Q0PD08 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab42Q0PD08 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab42Q0PD08 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab42Q0PD08 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab42Q0PD08 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab42Q0PD08 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab42Q0PD08 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab42Q0PD08 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab42Q0PD08 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab42Q0PD08 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab42Q0PD08 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab42Q0PD08 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab42Q0PD08 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab42Q0PD08 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab42Q0PD08 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab42Q0PD08 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab42Q0PD08 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab42Q0PD08 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab42Q0PD08 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab42Q0PD08 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab42Q0PD08 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab42Q0PD08 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab42Q0PD08 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab42Q0PD08 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab42Q0PD08 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab42Q0PD08 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab42Q0PD08 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab42Q0PD08 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab42Q0PD08 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab42Q0PD08 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab42Q0PD08 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab42Q0PD08 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab42Q0PD08 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab42Q0PD08 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab42Q0PD08 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab42Q0PD08 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab42Q0PD08 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab42Q0PD08 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab42Q0PD08 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab42Q0PD08 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab42Q0PD08 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab42Q0PD08 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab42Q0PD08 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab42Q0PD08 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab42Q0PD08 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab42Q0PD08 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab42Q0PD08 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab42Q0PD08 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab42Q0PD08 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab42Q0PD08 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab42Q0PD08 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab42Q0PD08 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab42Q0PD08 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab42Q0PD08 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab42Q0PD08 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab42Q0PD08 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab42Q0PD08 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab42Q0PD08 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab42Q0PD08 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab42Q0PD08 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab42Q0PD08 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab42Q0PD08 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms