Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CXCL9Q07325 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CXCL9Q07325 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CXCL9Q07325 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CXCL9Q07325 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CXCL9Q07325 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CXCL9Q07325 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CXCL9Q07325 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CXCL9Q07325 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CXCL9Q07325 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CXCL9Q07325 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CXCL9Q07325 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CXCL9Q07325 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CXCL9Q07325 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CXCL9Q07325 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CXCL9Q07325 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CXCL9Q07325 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CXCL9Q07325 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CXCL9Q07325 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CXCL9Q07325 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CXCL9Q07325 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CXCL9Q07325 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CXCL9Q07325 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CXCL9Q07325 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CXCL9Q07325 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CXCL9Q07325 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CXCL9Q07325 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CXCL9Q07325 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CXCL9Q07325 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CXCL9Q07325 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CXCL9Q07325 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CXCL9Q07325 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CXCL9Q07325 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CXCL9Q07325 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CXCL9Q07325 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CXCL9Q07325 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CXCL9Q07325 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CXCL9Q07325 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CXCL9Q07325 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CXCL9Q07325 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CXCL9Q07325 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CXCL9Q07325 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CXCL9Q07325 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CXCL9Q07325 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CXCL9Q07325 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CXCL9Q07325 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CXCL9Q07325 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CXCL9Q07325 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CXCL9Q07325 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CXCL9Q07325 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CXCL9Q07325 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CXCL9Q07325 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CXCL9Q07325 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CXCL9Q07325 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CXCL9Q07325 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CXCL9Q07325 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CXCL9Q07325 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CXCL9Q07325 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CXCL9Q07325 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CXCL9Q07325 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CXCL9Q07325 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CXCL9Q07325 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CXCL9Q07325 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CXCL9Q07325 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CXCL9Q07325 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CXCL9Q07325 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CXCL9Q07325 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CXCL9Q07325 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CXCL9Q07325 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CXCL9Q07325 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CXCL9Q07325 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CXCL9Q07325 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CXCL9Q07325 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CXCL9Q07325 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CXCL9Q07325 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CXCL9Q07325 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CXCL9Q07325 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CXCL9Q07325 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CXCL9Q07325 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CXCL9Q07325 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CXCL9Q07325 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CXCL9Q07325 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CXCL9Q07325 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CXCL9Q07325 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CXCL9Q07325 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CXCL9Q07325 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CXCL9Q07325 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CXCL9Q07325 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CXCL9Q07325 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CXCL9Q07325 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CXCL9Q07325 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CXCL9Q07325 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CXCL9Q07325 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CXCL9Q07325 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CXCL9Q07325 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CXCL9Q07325 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CXCL9Q07325 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CXCL9Q07325 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CXCL9Q07325 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CXCL9Q07325 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms