Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Top1Q04750 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Top1Q04750 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Top1Q04750 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Top1Q04750 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Top1Q04750 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Top1Q04750 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms