Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Thbs2Q03350 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Thbs2Q03350 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Thbs2Q03350 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Thbs2Q03350 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Thbs2Q03350 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Thbs2Q03350 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Thbs2Q03350 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Thbs2Q03350 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Thbs2Q03350 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Thbs2Q03350 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Thbs2Q03350 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Thbs2Q03350 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Thbs2Q03350 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Thbs2Q03350 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Thbs2Q03350 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Thbs2Q03350 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Thbs2Q03350 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Thbs2Q03350 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Thbs2Q03350 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Thbs2Q03350 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Thbs2Q03350 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Thbs2Q03350 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Thbs2Q03350 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Thbs2Q03350 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Thbs2Q03350 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Thbs2Q03350 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Thbs2Q03350 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Thbs2Q03350 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Thbs2Q03350 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Thbs2Q03350 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Thbs2Q03350 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Thbs2Q03350 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Thbs2Q03350 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Thbs2Q03350 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Thbs2Q03350 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Thbs2Q03350 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Thbs2Q03350 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Thbs2Q03350 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Thbs2Q03350 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Thbs2Q03350 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Thbs2Q03350 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Thbs2Q03350 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Thbs2Q03350 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Thbs2Q03350 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Thbs2Q03350 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Thbs2Q03350 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Thbs2Q03350 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Thbs2Q03350 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Thbs2Q03350 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms