Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pax8Q00288 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms