Protein–RNA interactions for Protein: P97468

Cmklr1, Chemokine-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmklr1P97468 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cmklr1P97468 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms