Protein–RNA interactions for Protein: P81117

Nucb2, Nucleobindin-2, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nucb2P81117 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nucb2P81117 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nucb2P81117 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nucb2P81117 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nucb2P81117 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nucb2P81117 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nucb2P81117 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nucb2P81117 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nucb2P81117 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nucb2P81117 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nucb2P81117 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nucb2P81117 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nucb2P81117 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nucb2P81117 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nucb2P81117 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nucb2P81117 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nucb2P81117 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nucb2P81117 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nucb2P81117 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nucb2P81117 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nucb2P81117 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nucb2P81117 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nucb2P81117 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nucb2P81117 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nucb2P81117 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nucb2P81117 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nucb2P81117 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nucb2P81117 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nucb2P81117 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nucb2P81117 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nucb2P81117 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nucb2P81117 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nucb2P81117 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nucb2P81117 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nucb2P81117 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nucb2P81117 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nucb2P81117 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nucb2P81117 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Nucb2P81117 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nucb2P81117 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Nucb2P81117 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nucb2P81117 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nucb2P81117 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Nucb2P81117 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nucb2P81117 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nucb2P81117 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nucb2P81117 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nucb2P81117 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nucb2P81117 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nucb2P81117 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nucb2P81117 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nucb2P81117 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nucb2P81117 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nucb2P81117 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nucb2P81117 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nucb2P81117 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Nucb2P81117 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Nucb2P81117 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nucb2P81117 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nucb2P81117 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nucb2P81117 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nucb2P81117 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nucb2P81117 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nucb2P81117 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nucb2P81117 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nucb2P81117 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nucb2P81117 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nucb2P81117 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Nucb2P81117 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Nucb2P81117 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Nucb2P81117 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nucb2P81117 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nucb2P81117 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nucb2P81117 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nucb2P81117 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nucb2P81117 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nucb2P81117 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nucb2P81117 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Nucb2P81117 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nucb2P81117 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nucb2P81117 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nucb2P81117 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nucb2P81117 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nucb2P81117 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nucb2P81117 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nucb2P81117 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nucb2P81117 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nucb2P81117 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nucb2P81117 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nucb2P81117 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nucb2P81117 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nucb2P81117 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nucb2P81117 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nucb2P81117 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nucb2P81117 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nucb2P81117 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Nucb2P81117 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nucb2P81117 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nucb2P81117 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nucb2P81117 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms