Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gfi1P70338 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gfi1P70338 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gfi1P70338 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gfi1P70338 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gfi1P70338 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gfi1P70338 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gfi1P70338 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gfi1P70338 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gfi1P70338 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gfi1P70338 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gfi1P70338 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gfi1P70338 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gfi1P70338 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gfi1P70338 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gfi1P70338 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gfi1P70338 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gfi1P70338 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gfi1P70338 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gfi1P70338 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gfi1P70338 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gfi1P70338 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gfi1P70338 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gfi1P70338 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gfi1P70338 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gfi1P70338 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gfi1P70338 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gfi1P70338 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gfi1P70338 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gfi1P70338 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gfi1P70338 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gfi1P70338 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gfi1P70338 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gfi1P70338 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gfi1P70338 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gfi1P70338 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gfi1P70338 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gfi1P70338 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gfi1P70338 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gfi1P70338 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gfi1P70338 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gfi1P70338 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gfi1P70338 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gfi1P70338 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gfi1P70338 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gfi1P70338 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gfi1P70338 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gfi1P70338 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gfi1P70338 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gfi1P70338 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gfi1P70338 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gfi1P70338 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gfi1P70338 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gfi1P70338 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gfi1P70338 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gfi1P70338 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gfi1P70338 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gfi1P70338 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gfi1P70338 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gfi1P70338 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gfi1P70338 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gfi1P70338 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gfi1P70338 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gfi1P70338 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gfi1P70338 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gfi1P70338 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gfi1P70338 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gfi1P70338 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gfi1P70338 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gfi1P70338 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gfi1P70338 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gfi1P70338 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gfi1P70338 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gfi1P70338 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gfi1P70338 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gfi1P70338 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms