Protein–RNA interactions for Protein: P62858

Rps28, 40S ribosomal protein S28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps28P62858 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rps28P62858 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rps28P62858 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rps28P62858 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rps28P62858 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms