Protein–RNA interactions for Protein: P50706

Defa8, Alpha-defensin 8 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa8P50706 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa8P50706 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa8P50706 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa8P50706 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa8P50706 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa8P50706 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa8P50706 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa8P50706 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa8P50706 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa8P50706 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa8P50706 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Defa8P50706 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Defa8P50706 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa8P50706 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa8P50706 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa8P50706 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms