Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Mmp9P41245 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Mmp9P41245 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Mmp9P41245 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
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