Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gja1P23242 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gja1P23242 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gja1P23242 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gja1P23242 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gja1P23242 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gja1P23242 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gja1P23242 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gja1P23242 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gja1P23242 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gja1P23242 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gja1P23242 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gja1P23242 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gja1P23242 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gja1P23242 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gja1P23242 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gja1P23242 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gja1P23242 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gja1P23242 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gja1P23242 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gja1P23242 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms