Protein–RNA interactions for Protein: P17679

Gata1, Erythroid transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata1P17679 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gata1P17679 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gata1P17679 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gata1P17679 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gata1P17679 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gata1P17679 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gata1P17679 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gata1P17679 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gata1P17679 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gata1P17679 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gata1P17679 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms