Protein–RNA interactions for Protein: P06728

Apoa4, Apolipoprotein A-IV, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa4P06728 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apoa4P06728 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apoa4P06728 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apoa4P06728 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apoa4P06728 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apoa4P06728 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apoa4P06728 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apoa4P06728 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apoa4P06728 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apoa4P06728 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apoa4P06728 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Apoa4P06728 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apoa4P06728 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apoa4P06728 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apoa4P06728 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apoa4P06728 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apoa4P06728 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apoa4P06728 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apoa4P06728 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apoa4P06728 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apoa4P06728 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Apoa4P06728 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apoa4P06728 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apoa4P06728 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apoa4P06728 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms