Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sp100O35892 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sp100O35892 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Sp100O35892 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sp100O35892 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sp100O35892 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sp100O35892 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sp100O35892 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sp100O35892 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sp100O35892 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sp100O35892 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sp100O35892 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sp100O35892 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sp100O35892 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sp100O35892 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Sp100O35892 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sp100O35892 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sp100O35892 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sp100O35892 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sp100O35892 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sp100O35892 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sp100O35892 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sp100O35892 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sp100O35892 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sp100O35892 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sp100O35892 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sp100O35892 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sp100O35892 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sp100O35892 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sp100O35892 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sp100O35892 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sp100O35892 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sp100O35892 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sp100O35892 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sp100O35892 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sp100O35892 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sp100O35892 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sp100O35892 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sp100O35892 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sp100O35892 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sp100O35892 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sp100O35892 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sp100O35892 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sp100O35892 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sp100O35892 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sp100O35892 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sp100O35892 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sp100O35892 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Sp100O35892 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sp100O35892 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sp100O35892 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Sp100O35892 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sp100O35892 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sp100O35892 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sp100O35892 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sp100O35892 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sp100O35892 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sp100O35892 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sp100O35892 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sp100O35892 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sp100O35892 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sp100O35892 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sp100O35892 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sp100O35892 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sp100O35892 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sp100O35892 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sp100O35892 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sp100O35892 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sp100O35892 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Sp100O35892 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sp100O35892 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sp100O35892 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sp100O35892 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sp100O35892 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sp100O35892 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sp100O35892 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sp100O35892 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sp100O35892 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sp100O35892 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sp100O35892 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms