Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6D7

1700024B05Rik, RIKEN cDNA 1700024B05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700024B05RikE9Q6D7 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700024B05RikE9Q6D7 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700024B05RikE9Q6D7 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700024B05RikE9Q6D7 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700024B05RikE9Q6D7 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700024B05RikE9Q6D7 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700024B05RikE9Q6D7 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700024B05RikE9Q6D7 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700024B05RikE9Q6D7 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700024B05RikE9Q6D7 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700024B05RikE9Q6D7 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700024B05RikE9Q6D7 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700024B05RikE9Q6D7 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700024B05RikE9Q6D7 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700024B05RikE9Q6D7 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700024B05RikE9Q6D7 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700024B05RikE9Q6D7 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700024B05RikE9Q6D7 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700024B05RikE9Q6D7 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700024B05RikE9Q6D7 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700024B05RikE9Q6D7 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700024B05RikE9Q6D7 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700024B05RikE9Q6D7 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700024B05RikE9Q6D7 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700024B05RikE9Q6D7 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700024B05RikE9Q6D7 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
1700024B05RikE9Q6D7 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700024B05RikE9Q6D7 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
1700024B05RikE9Q6D7 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700024B05RikE9Q6D7 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
1700024B05RikE9Q6D7 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700024B05RikE9Q6D7 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700024B05RikE9Q6D7 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700024B05RikE9Q6D7 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700024B05RikE9Q6D7 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700024B05RikE9Q6D7 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700024B05RikE9Q6D7 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700024B05RikE9Q6D7 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700024B05RikE9Q6D7 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
1700024B05RikE9Q6D7 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700024B05RikE9Q6D7 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700024B05RikE9Q6D7 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700024B05RikE9Q6D7 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700024B05RikE9Q6D7 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700024B05RikE9Q6D7 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700024B05RikE9Q6D7 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700024B05RikE9Q6D7 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700024B05RikE9Q6D7 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700024B05RikE9Q6D7 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700024B05RikE9Q6D7 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700024B05RikE9Q6D7 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700024B05RikE9Q6D7 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
1700024B05RikE9Q6D7 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700024B05RikE9Q6D7 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700024B05RikE9Q6D7 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700024B05RikE9Q6D7 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700024B05RikE9Q6D7 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
1700024B05RikE9Q6D7 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700024B05RikE9Q6D7 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700024B05RikE9Q6D7 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700024B05RikE9Q6D7 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700024B05RikE9Q6D7 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700024B05RikE9Q6D7 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700024B05RikE9Q6D7 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700024B05RikE9Q6D7 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700024B05RikE9Q6D7 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700024B05RikE9Q6D7 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700024B05RikE9Q6D7 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700024B05RikE9Q6D7 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700024B05RikE9Q6D7 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700024B05RikE9Q6D7 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700024B05RikE9Q6D7 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700024B05RikE9Q6D7 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700024B05RikE9Q6D7 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700024B05RikE9Q6D7 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700024B05RikE9Q6D7 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700024B05RikE9Q6D7 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700024B05RikE9Q6D7 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700024B05RikE9Q6D7 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700024B05RikE9Q6D7 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
1700024B05RikE9Q6D7 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700024B05RikE9Q6D7 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700024B05RikE9Q6D7 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700024B05RikE9Q6D7 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700024B05RikE9Q6D7 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700024B05RikE9Q6D7 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700024B05RikE9Q6D7 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700024B05RikE9Q6D7 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700024B05RikE9Q6D7 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700024B05RikE9Q6D7 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700024B05RikE9Q6D7 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700024B05RikE9Q6D7 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700024B05RikE9Q6D7 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700024B05RikE9Q6D7 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700024B05RikE9Q6D7 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700024B05RikE9Q6D7 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700024B05RikE9Q6D7 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700024B05RikE9Q6D7 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700024B05RikE9Q6D7 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700024B05RikE9Q6D7 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms