Protein–RNA interactions for Protein: C0LLJ0

Kpna7, Importin subunit alpha-8, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna7C0LLJ0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Kpna7C0LLJ0 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kpna7C0LLJ0 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kpna7C0LLJ0 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kpna7C0LLJ0 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kpna7C0LLJ0 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kpna7C0LLJ0 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kpna7C0LLJ0 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kpna7C0LLJ0 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kpna7C0LLJ0 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kpna7C0LLJ0 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kpna7C0LLJ0 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kpna7C0LLJ0 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kpna7C0LLJ0 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kpna7C0LLJ0 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kpna7C0LLJ0 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kpna7C0LLJ0 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kpna7C0LLJ0 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kpna7C0LLJ0 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kpna7C0LLJ0 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kpna7C0LLJ0 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kpna7C0LLJ0 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kpna7C0LLJ0 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kpna7C0LLJ0 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kpna7C0LLJ0 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kpna7C0LLJ0 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kpna7C0LLJ0 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kpna7C0LLJ0 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kpna7C0LLJ0 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kpna7C0LLJ0 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kpna7C0LLJ0 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kpna7C0LLJ0 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kpna7C0LLJ0 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kpna7C0LLJ0 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kpna7C0LLJ0 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kpna7C0LLJ0 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kpna7C0LLJ0 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kpna7C0LLJ0 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kpna7C0LLJ0 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Kpna7C0LLJ0 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kpna7C0LLJ0 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kpna7C0LLJ0 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kpna7C0LLJ0 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kpna7C0LLJ0 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kpna7C0LLJ0 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kpna7C0LLJ0 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kpna7C0LLJ0 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kpna7C0LLJ0 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kpna7C0LLJ0 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kpna7C0LLJ0 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Kpna7C0LLJ0 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kpna7C0LLJ0 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kpna7C0LLJ0 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kpna7C0LLJ0 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kpna7C0LLJ0 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kpna7C0LLJ0 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Kpna7C0LLJ0 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms