Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE4

Znf518b, Zinc finger protein 518B, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518bB2RRE4 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Znf518bB2RRE4 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Znf518bB2RRE4 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Znf518bB2RRE4 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Znf518bB2RRE4 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Znf518bB2RRE4 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Znf518bB2RRE4 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Znf518bB2RRE4 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Znf518bB2RRE4 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Znf518bB2RRE4 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Znf518bB2RRE4 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Znf518bB2RRE4 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Znf518bB2RRE4 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Znf518bB2RRE4 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Znf518bB2RRE4 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Znf518bB2RRE4 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Znf518bB2RRE4 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Znf518bB2RRE4 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Znf518bB2RRE4 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf518bB2RRE4 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf518bB2RRE4 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf518bB2RRE4 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf518bB2RRE4 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf518bB2RRE4 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf518bB2RRE4 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf518bB2RRE4 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf518bB2RRE4 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf518bB2RRE4 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf518bB2RRE4 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf518bB2RRE4 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf518bB2RRE4 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf518bB2RRE4 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf518bB2RRE4 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf518bB2RRE4 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf518bB2RRE4 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Znf518bB2RRE4 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Znf518bB2RRE4 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Znf518bB2RRE4 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Znf518bB2RRE4 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Znf518bB2RRE4 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Znf518bB2RRE4 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Znf518bB2RRE4 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Znf518bB2RRE4 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Znf518bB2RRE4 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Znf518bB2RRE4 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Znf518bB2RRE4 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Znf518bB2RRE4 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Znf518bB2RRE4 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Znf518bB2RRE4 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Znf518bB2RRE4 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Znf518bB2RRE4 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Znf518bB2RRE4 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Znf518bB2RRE4 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Znf518bB2RRE4 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Znf518bB2RRE4 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Znf518bB2RRE4 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Znf518bB2RRE4 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Znf518bB2RRE4 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Znf518bB2RRE4 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Znf518bB2RRE4 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Znf518bB2RRE4 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Znf518bB2RRE4 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Znf518bB2RRE4 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Znf518bB2RRE4 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Znf518bB2RRE4 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Znf518bB2RRE4 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Znf518bB2RRE4 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Znf518bB2RRE4 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Znf518bB2RRE4 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Znf518bB2RRE4 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Znf518bB2RRE4 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Znf518bB2RRE4 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Znf518bB2RRE4 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Znf518bB2RRE4 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Znf518bB2RRE4 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Znf518bB2RRE4 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Znf518bB2RRE4 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Znf518bB2RRE4 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Znf518bB2RRE4 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Znf518bB2RRE4 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Znf518bB2RRE4 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Znf518bB2RRE4 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Znf518bB2RRE4 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Znf518bB2RRE4 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Znf518bB2RRE4 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Znf518bB2RRE4 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Znf518bB2RRE4 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Znf518bB2RRE4 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Znf518bB2RRE4 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Znf518bB2RRE4 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Znf518bB2RRE4 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Znf518bB2RRE4 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Znf518bB2RRE4 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Znf518bB2RRE4 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Znf518bB2RRE4 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Znf518bB2RRE4 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Znf518bB2RRE4 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Znf518bB2RRE4 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Znf518bB2RRE4 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Znf518bB2RRE4 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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